Есть Krusader (Kde в Gnome). У него есть функционал "Закладки". Добавить закладку можно, отредактировать нельзя. Глюк такой.

Редактируем закладки вручную: открыть файл /home/%username%/.kde/share/apps/krusader/krbookmarks.xml и разобраться в нем вручную - это обычный xml файл.

Внимание к особенностям объявления каталогов в этом файле: у заголовка каталога в закладках определенное место:

 <folder icon="">

  <title>android</title>

 <bookmark icon="" href="file:///media/1355-7EF3">
  <title>m&yAndroid</title>
 </bookmark>

 </folder>