На самом деле кино поднимает интересный вопрос - вот с одной стороны тупо нацисты.
С другой - тупо шахиды.

Воюют шахиды против нацистов.
Внимание, вопрос - на чьей стороне ты?

Книга тоже ставила тот же вопрос, но при этом - копала его значительно глубже.
Вот есть Харконены - реально монстры. Лысые, серые, стремные. Орки.
Почему они такие?

А они такие не просто так - а потом что это оккупационная администрация.
Потому что Дюна была захвачена Империей поколения назад, и требовался кто-то, кто будет с одной стороны контролировать поставки спайса, с другой - кто не сможет весь спайс захватить и диктовать императору свои условия.
Монстры для этой цели удобнее всего.
С одной стороны - они терроризируют местное население, и то не может свои силы самоуправления создать.
С другой - у монстров нет никаких политических перспектив. Они всем настолько отвратительны, что у них нет союзников, единственное что держит их у власти - император лично. Они ему всем обязаны, и любая друга власть их снесет. Короче Харконены это аналог Кадырова.

Почему оккупационные администрации постоянно какими-то зверствами занимаются - а вот поэтому. У них нет выбора.
В этом проблема любой нелегитимной власти. Она вынуждена становиться монстром. Собственно всегда почти любые акции устрашения населения - признак нелегитимности. Обычно принято считать типо вот они такие уроды и поэтому народ их ненавидит. На самом деле наоборот. Народ их ненавидит и поэтому они вынуждены становиться уродами, чтобы тупо с ними связываться никто не хотел.

Далее у нас есть Атридесы - которые опять же в экранизациях выступают как такие хорошие наивные парни, вот они попали в ловушку злодеев и их перебили. На самом деле Атридесы прекрасно знали, что их ждет на Дюне, но надеялись это пережить. Атридесы это аналог Навального, крупнейшая оппозиционная партия в империи. У них то в отличие от Харконенов как раз изначально были амбиции на имперский престол, и они надеялись как-то извернуться, и потом выставить императора мудаком, и как раз Атридесов-то другие дома бы поддержали, у них на фоне загибающейся императорской власти были все шансы на победу. Атридесы безусловно были все в белом, со своего Каладана, за все хорошее против всего плохо и так далее. Но они таковыми тоже были не просто так - легальная оппозиция всегда такая. Она вынуждена быть таковой. Она вынуждена топить за светлую вселенную будущего в противовес бюрократическому болоту.

При этом Атридесы ожидали, что на Дюне их будут гнобить, но не ожидали что прямо вот введут войска масштабно и переубивают. Потому что для империи это было самоубийственное поведение. Собственно, сносить императора после этого Атридесам уже не требовалось, его бы тупо снесли бы другие дома под страхом аналогичного ввода войск. И в финале, когда имперская принцесса идет на брак с Полом Атридесом - это в кино она идет на брак под угрозами. В книге угрозы тоже есть, но суть там в том, что этот брак нужен самой империи и без всяких угроз. Империя сама слилась фактом своей атаки на Атридесов. Брак это легитимный способ передачи власти другому дому, иначе бы тупо гражданская война началась.

Далее есть фримены. Дикие племена. И когда Пол к ним попадает, по книге, он в целом понимает, что ему нет никакого резона затевать вот всю эту войну против Харконенов. Ему достаточно вылететь с планеты и выступить на совете домов (читай на ассамблее ООН) свидетелем атаки. Собственно и все. Далее императора снесут, Харконеннов тоже снесут.
Идея приводить к власти шахидов - не супер интересна Полу. Пол какбы изначально готов поддерживать шахидскую псевдо-религию, отлично при этом зная кто эту религию создал и зачем, но чисто для личного выживания на первых порах.

Однако тут вмешивается фантастический фактор - Пол выпивает волшебной воды и начинает видеть будущее.
И в будущем он видит нашествие роботов, видит, что нужно готовить к этому нашествию человечество, для чего требуется тоталитарная уже власть. То есть мало просто вот выйти на совет домов, что видимо закончится тем же самым династическим браком с Ирулан, император скорее всего выставит все как харконенскую инициативу (дык монстры же), и все спустят на тормозах, и фактически империя после этого продолжит существовать в своем сумбурном подгнивающем виде.

И эта тоталитарная власть, которую требуется создать не против империи, не против харконенов, а против роботов, которые там еще через десять веков придут - это шахиды.
И вот только после этого Пол решается начинать войну с шахидами против нацистов.

То есть в книге на самом деле скрытая серая мораль, и все хороши, и у всех есть причины выглядеть так как они выглядят, и хорошей стороны здесь нет.