Лат. numero - "считать", оказалось родственным осет. нымайын [nymajyn] и тохар. Б mai- с тем же значением.
Словарь индоевропейских слов IELex считает, что греч. μέτρο "измерять" родственно лат. numero.
Сравнением латинского и осетинского слов с тохарским и греческим словами получаем, что либо греки с тохарами "потеряли" начальный слог, либо латинский оригинал (про осетинский труднее копать) является сложным образованием с префиксом nu- (в некоторых лат. словах nu- - сокращение от nova "новый").

Приставка nu- заведомо есть в литовском языке:
В литовском в прошедшем (не хабитуальном) времени также возможна синонимия префиксальных и беспрефиксальных глаголов :
(24) Mir ė legendinė sgrupės «Vairas» vokalistas ‘Умер вокалист легендарной группы «Вайрас»’.
(25) Seniausia pasaulio avis numirė ‘Самая старая в мире овца умерла (prev.)’.

Если от numerus "число; соразмерность, правильность" отнять nu-, то полученное merus будет означать "чистый; истинный". Семантически похоже на "число", которое суть чистая абстракция.

Проверка по лат.-рус. словарю выявила ещё одну подозрительную комбинацию:
numen "воля; согласие; знак божественного могущества; духи дорогих покойников, маны"
при mens "разум, совесть, могущество, намерение" и manes - "духи умерших; покойник", синоним к numen.
Есть ещё manus II "добрый, добросердечный", видимо, родственное к manes: manes полагались добрыми духами.

Наконец, есть древнегреческое νούμενον "постигаемая сущность", где разделение на части очевидно: νοέω "постигаю" + μένος "сущность".

UPD: В связи с явлением инверсного развития носовых гласных, ясно, что эта приставка "nu-" суть результат эволюции приимённой приставки, выраженной в старославянском "ѫ-" и трансформировавшейся в русском в "у-": ѫвозъ > увоз; ѫтроба "внутренности" > лат. nutrire "кормить"; ум ~ numen "воля, согласие"; см. ткж. выше пример с литовской умершей овцой ( которая numirė).
Лат. numero "считать" должно восходить к некоему *ѫмеръ, связанному с мера.