Такая возможность была в 10.4, но в 10.5 Apple ее почему-то убрала. Для того, чтобы ее вернуть, нужно:

1. Скачать и установить SIBML.

2. Затем надо скачать и установить InputSwitcher (cайт). Из него файлы надо установить в:
InputSwitcher.app -> /Applications
InputSwitcherClient.bundle -> ~/Library/Application Support/SIMBL/Plugins

Запустите InputSwitcher.app - теперь программа будет сохранять состояние раскладки клавиатуры для запущенных приложений (если при установке такие были, их придется перезапустить).