http://ithappens.ru/story/985 - показательная история. Сам я попался подобным образом один раз давно, когда игрался с одной из первых версий Slackware. С тех пор я никогда не запускаю команды типо chmod или rm из текущей директории - всегда перехожу на директорию выше и запускаю что-то вроде "chmod -R 777 ./folder". Береженого бог бережет.