По версии источников "Ъ", на предполагаемых участников громкого убийства удалось выйти благодаря экспертам, которые по гильзам и пулям установили, что роковые выстрелы были произведены из автомата для бесшумной стрельбы системы "Вал". Данное оружие, как установили эксперты, боевиками в Дагестане не использовалось, зато состояло на вооружении и применялось местными и федеральными силовиками. В итоге на причастность к преступлению начали проверять в первую очередь не участников банд экстремистов, а сотрудников дислоцированных в республике спецназов разных ведомств. Под подозрения, в частности, попали спецназы УФСКН, УФСБ и бойцы горнострелковой бригады Минобороны, дислоцированной в высокогорном селении Ботлих. Как утверждают источники, близкие к следствию, оружие для экспертизы в бригаде удалось получить только через несколько месяцев и с большим трудом. Для этого якобы понадобилась согласовывать вопрос на уровне министерства.

В результате сравнительных экспертиз специалисты пришли к выводу, что выстрелы в главу МВД были произведены из автомата, закрепленного за одним из офицеров бригады. По версии следствия, он получил автомат утром 5 июня, а вечером вернул его в оружейку. Военнослужащего задержали, и на допросе он назвал имена своих подельников, которые следили за зданием ресторана и подвозили его. А уже кто-то из них вывел следствие на предполагаемого организатора преступления. Все они оказались жителями Ботлихского района.