Клоны и штормтруперы это НЕ одно и то же.

Во-первых, Палпатин изначально зашивал всем клонам устройства, позволяющие промыть им мозги для осуществления приказа 66. То есть в момент отдачи приказа - клоны стали зомбями.

Во-вторых, после захвата власти - Палпатин отключил производство клонов, боясь, что кто-нибудь проведёт с ним точно такой же трюк.
Имеющихся клонов постепенно сменяла регулярная армия. Хотя некоторое количество клонов в войсках империи оставалось. В первую очередь - крупный отряд элитных клонов всегда летал с Дартом Вейдером (см. отряд 501 ака "Кулак Вейдера").

Однако те войска, которые дерутся с евоками, например, в шестом эпизоде - это уже точно не клоны.
Собственно это объясняет, почему главный герой седьмого эпизода - не клон Фетта. Хотя и штормтрупер.