Всего отверстий 6: два для глаз, два под крылья (или 4 -- но это крайне редко), оно в шее и одно в подбородке.
Под глаза делать проще всего: они протыкаются уже после того, как пришит и обшит "белок". И сами глаза вставляются уже по самый конец работы над головой.

Отверстия шея+подбородок и под крылья есть ещё не выкройке, и с ними всегда было много проблем: не всегда легко наметить "насквозь" (чтоб наметка, сделанная на изнанке, была видна на лицевой -- иногда она вообще теряется), да и протыкать приходится, когда почти всё уже сшито. Плюс всегда есть риск прорвать одну нитку, и тогда вся работа насмарку.

Новая технология обработки/фиксации отверстий, во-первых, снимает проблему "как перевести точку с изнанки на лицевую", а во-вторых, полностью снимает риск нечаянно прорвать ткань при протыкании.

Суть в новой технологии в следующем:
1. делается точка на изнанке при обводе выкройки;
2. когда деталь вырезана, точка протыкается -- сначала толстой иглой, потом раздвигается зубочисткой;
3. место вокруг отверстия обрабатывается с изнанки прозрачным клеем-гелем -- диаметр около 3 мм; обрабатывать надо так, чтобы гель пропитал ткань и внутри раздвинутого отверстия; клея должно быть много: нашлёпка высотой как минимум полтора мм;
4. деталь оставляется на просушку как минимум на сутки, а лучше на двое;
5. отверстие повторно протыкается -- сначала толстой иглой, потом раздвигается зубочисткой;
6. зубочистку можно не вынимать (оставаться она должна от часа до суток);
7. когда приходит очередь работы с соединением деталей, отверстие заметно и обработано.

По временным затратам -- то же самое, что и старым способом.
По эффективности и безопасности -- на порядок лучше.